好氧菌是经过人工挑选驯化的多种需氧微生物的总称，主要包含硝化细菌属、反硝化细菌属、芽孢杆菌属、假单胞菌属和活化酶以及多糖等其它营养物。好氧菌在污水处理上投加在好氧池，用来提高COD、BOD、氨氮、总磷等的去除率。好氧菌能够分解表面活性剂、碳氢化合物、酚类化合物、蛋白所以及不易分解的有机物，把它们最终分解成二氧化碳和水等小分子物质。好氧菌剂对水体中有机质有很好的降解功能。由于芽孢菌群对外界有害因子极强的抵抗力，使污水处理系统有较高的抗负荷冲击能力，处理能力强，在污水浓度发生大幅度的变化时系统也能正常运转，保证出水稳定排放；厌氧菌在污水处理上投加在厌氧池，主要是改进厌氧池内发酵环境，促进各种厌氧微生物快速生长繁殖，如甲烷菌，加速发酵料的分解，增加产气量，提高厌氧槽降解效率。将微生物难降解物质转变为易降解物质，将水解产物转化成各种有机酸和氢；提高水质的可生化性，提高后端生化系统的效率
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