vaGreen 是一种用于实时定量PCR(qPCR)的DNA结合染料。该染料的诸多优点使它远胜于SYBR Green I。除了有相似的光谱特性, EvaGreen有三个主要特点使它区别于SYBR Green I。
1.EvaGreen对PCR的抑制性远小于SYBR Green I,因此,使用EvaGreen进行的qPCR实验可以使用快速PCR步骤。
2.EvaGreen在实验中可以使用较高的浓度,从而获得远强于SYBR Green I扩增信号;较高浓度的EvaGreen也消除了“染料重分布”的缺陷,使EvaGreen既可用于多重PCR,也可用于高分辨率(高清晰)熔解曲线分析( HRM );该分析正被越来越多的用于PCR后的基因分型和异源双链分析。由于SYBR Green I 对PCR的抑制性,从而要求其使用浓度必须很低,因此SYBR Green I无法解决由低浓度造成的染料重分布问题,既不能用于多重PCR也不能用于HRM。同时,染料重分布问题也可能影响常规熔解曲线的可靠性,因为低熔点的DNA链可能由于这种原因而无法检测到。
3.EvaGreen 的稳定性极好。在正常的储存、操作和PCR过程中不会被破坏。在缓冲溶液中的染料可以安全的储存在室温或冰箱里,也可以反复冻融。与之相反,SYBR Green I不稳定而且降解后对PCR抑制性更强。
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